Spatial Transcriptomics

定义 Definition

空间转录组学：一种在保留组织空间位置信息的前提下，测量基因表达（RNA 转录本）分布的技术与研究方法，用于揭示不同细胞或组织区域在“哪里表达了什么基因”，常用于肿瘤、神经科学、发育生物学与病理研究等领域。（也常与单细胞 RNA 测序互补使用。）

发音 Pronunciation (IPA)

/ˈspeɪʃəl trænˌskrɪpˈtoʊmɪks/

例句 Examples

Spatial transcriptomics helps researchers see which genes are active in different parts of a tissue.
空间转录组学帮助研究者观察组织不同区域中哪些基因处于活跃表达状态。

By integrating spatial transcriptomics with single-cell RNA sequencing, the team mapped cell types and signaling pathways across the tumor microenvironment.
通过将空间转录组学与单细胞 RNA 测序整合，研究团队绘制了肿瘤微环境中细胞类型与信号通路的空间分布图谱。

词源 Etymology

spatial 来自拉丁语 spatium（“空间、距离”），表示与空间位置相关；transcriptomics 由 transcript（转录本）+ -omics（“组学”，表示对某一整体集合的大规模研究）构成。合起来强调：在组织的空间坐标上研究转录本整体图谱。

相关词 Related Words

• Spatial
• Transcriptome
• Transcriptomics
• Single-Cell
• Single-Cell RNA Sequencing
• RNA Sequencing
• In Situ Hybridization
• Tissue Microenvironment
• Gene Expression
• Cell Atlas

文献/作品中的出现 Notable Works

• Ståhl, P. L. et al. “Visualization and analysis of gene expression in tissue sections by spatial transcriptomics.” (Science, 2016)
• Rodriques, S. G. et al. “Slide-seq: A scalable technology for measuring genome-wide expression at high spatial resolution.” (Science, 2019)
• Vickovic, S. et al. “High-definition spatial transcriptomics for in situ tissue profiling.” (Nature Methods, 2019)
• Bergenstråhle, J. et al. 相关综述与方法论文中频繁使用该术语（空间转录组学方法学与应用综述，见 Nature Reviews 系列期刊中多篇文章）