Bulk Sequencing

定义 Definition

“Bulk sequencing”（群体/混合样本测序、整体测序）指把来自许多细胞或个体的核酸（DNA/RNA）混在一起作为一个样本进行测序，从而得到总体平均的基因组或转录组信息。常用于与“single-cell sequencing（单细胞测序）”对比。

发音 Pronunciation (IPA)

/bʌlk ˈsiːkwənsɪŋ/

例句 Examples

Bulk sequencing gives an average signal across all cells in the sample.
整体（群体）测序会给出样本中所有细胞的平均信号。

While bulk sequencing can reveal major expression changes, it may miss rare cell types that single-cell methods can detect.
虽然群体测序能揭示主要的表达变化，但它可能会漏掉单细胞方法能够检测到的稀有细胞类型。

词源 Etymology

“Bulk”原意与“整体的一大块/大体量”相关，来自古诺尔斯语 bulki（意为“货物/一堆”之类的概念），在现代英语里常指“总体、整批”。“Sequencing”来自“sequence（序列）”，而“sequence”源自拉丁语 sequi（“跟随”），引申为“按顺序排列”。合在一起，“bulk sequencing”字面上就是“对整批混合材料进行测序”。

相关词 Related Words

• Transcriptomics
• Genomics
• RNA-Seq
• Single-Cell Sequencing
• Library Preparation
• Read Depth
• Differential Expression
• Pooling

文献与作品 Literary/Notable Works

• Lähnemann, D. et al. “Eleven grand challenges in single-cell data science.” Genome Biology (2020)（文中多处以“bulk”数据/测序与单细胞进行对照讨论）
• Stuart, T. & Satija, R. “Integrative single-cell analysis.” Nature Reviews Genetics (2019)（讨论单细胞分析时经常以“bulk RNA-seq/ bulk sequencing”作为对比基线）
• Crow, M. et al. “Characterizing the replicability of cell types defined by single cell RNA-sequencing data using MetaNeighbor.” Nature Communications (2018)（涉及单细胞结果与bulk信号/基线的关系与比较）