Drop-seq
释义 Definition
一种单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术:通过微流控把单个细胞与带条形码(barcode)的微珠一起封装进微小液滴(droplets)中,使每个细胞的转录本在后续测序中可被区分并进行高通量表达谱分析。(常用于大规模单细胞转录组研究;也可泛指此类“液滴式单细胞测序”方法的一种代表。)
发音 Pronunciation (IPA)
/ˈdrɑːp sɛk/
例句 Examples
Drop-seq can profile thousands of single cells in one experiment.
Drop-seq 可以在一次实验中分析成千上万个单细胞的表达情况。
Using Drop-seq, the team mapped cell-type diversity in mouse brain tissue and identified rare neuronal subpopulations.
研究团队使用 Drop-seq 绘制了小鼠脑组织的细胞类型多样性图谱,并识别出罕见的神经元亚群。
词源 Etymology
由 drop(液滴)+ seq(sequencing 的缩写,意为“测序”)构成,字面意思是“液滴测序”。名称强调其核心流程:在液滴中完成单细胞与条形码标记的对应,再进行测序读出。
相关词 Related Words
文学与作品 Literary Works
- Macosko, E. Z. et al. Highly Parallel Genome-wide Expression Profiling of Individual Cells Using Nanoliter Droplets (Drop-seq). Cell (2015).
- Klein, A. M. et al. Droplet Barcoding for Single-Cell Transcriptomics Applied to Embryonic Stem Cells. Cell (2015)(与 Drop-seq 同时期的液滴单细胞转录组代表工作,常与 Drop-seq 并列引用)。
- Lähnemann, D. et al. Eleven grand challenges in single-cell data science. Genome Biology (2020)(综述中讨论单细胞技术谱系时常提及 Drop-seq)。