RIP-seq:RNA 免疫共沉淀测序(RNA ImmunoPrecipitation sequencing)。一种把特定 RNA 结合蛋白(RBP)及其结合的 RNA通过抗体“拉下”(免疫沉淀),再对富集到的 RNA 进行高通量测序的方法,用于鉴定蛋白-RNA 相互作用及其靶 RNA。
/ˈrɪp sɛk/
RIP-seq can identify RNAs bound by a specific protein.
RIP-seq 可以鉴定与某一种特定蛋白结合的 RNA。
Using RIP-seq, the team mapped the transcript targets of the RNA-binding protein and compared binding patterns across conditions.
研究团队利用 RIP-seq 绘制该 RNA 结合蛋白的转录本靶标图谱,并比较不同条件下的结合模式。
RIP-seq 是实验方法名的缩写:RIP 来自 RNA immunoprecipitation(RNA 免疫共沉淀),seq 来自 sequencing(测序)。整体含义即“把蛋白-RNA 复合物做免疫沉淀后再测序”。